Onilo.de wurde am Freitag, 22. Juni 2012 bei der Vergabe der Bildungsmedienpreise mit dem Comenius-EduMedia-Siegel ausgezeichnet. Mit den begehrten Comenius-Auszeichnungen prämiert die Gesellschaft für Pädagogik und Information e.V. (GPI) jedes Jahr inhaltlich und gestalterisch herausragende didaktische Multimedia-Produkte im Bildungsbereich.
Seit 1995 wird die Comenius-Auszeichnung herausragende Multimedia-Produkte verliehen. Die Auszeichnung gilt als einer der bedeutendsten Multimediapreise in Europa.